Klyngeorganisationer har hidtil været sidestillet med offentlige eller halvoffentlige operatører som Væksthuse, GTS-institutter, erhvervskontorer mv., det vil sige aktører der fortrinsvis udfører opgaver af public servicelignende karakter.
Konsekvensen af nye statsstøtteregler fra EU er, at en klyngeorganisation fremover i mange tilfælde må gå fra en potentiel offentlig støtte på 100 procent til generelle driftsaktiviteter, som for nogle vækstfora er hovedreglen i dag, til en offentlig støtte på op til 50 procent. Det vurderes at være endog meget vanskeligt for klyngeorganisationerne at finde 50 procent privat medfinansiering til generelle driftsudgifter, som ikke er direkte virksomhedsrettede. Særligt i forhold til spirende klynger anses 50 procent privat medfinansiering at være en umulighed.
